Évaluation de Xpert MTB / RIF par rapport à frottis et culture AFB pour identifier la tuberculose pulmonaire chez les patients atteints de tuberculose soupçonnée à partir de paramètres de prévalence faible et plus élevé

Contexte Le test Xpert MTB / RIF Xpert est un test rapide d’amplification des acides nucléiques largement utilisé dans les contextes de forte prévalence de la tuberculose pour détecter la tuberculose ainsi que des mutations rpoB associées à la résistance à la rifampicine. Methods Xpert a été comparé à des échantillons d’expectorations, chacun évalué avec des bacilles acido-alcoolo-résistants et une culture mycobactérienne en utilisant des milieux de culture liquides et solides provenant de participants suspectés de tuberculose pulmonaire aux États-Unis, Au Brésil, et en Afrique du SudRésultats Parmi les participants inscrits avec des résultats évaluables,% présentaient une tuberculose confirmée par la culture. Dans% des participants américains, Xpert a démontré une sensibilité de%% chez les participants avec expectorations AFB à frottis positif,% avec frottis AFB négatif [AFB -] crachat, spécificité de%, valeur prédictive négative NPV de%, et positiv La valeur prédictive de% Résultats ne différait pas entre les paramètres de prévalence plus élevée et faible Un deuxième test Xpert a augmenté la sensibilité globale à%% si AFB,% si AFB-, avec une spécificité de% Dans les participants américains, un seul résultat Xpert négatif prédit la absence de tuberculose AFB / culture positive avec une VAN de%; Xpert a détecté un ADN de tuberculose et des mutations associées à la résistance à la rifampicine chez des participants atteints de tuberculose résistante à la rifampine, culture positive. La spécificité pour la résistance à la rifampicine était de% et la VAN était de% Conclusions Aux États-Unis, les tests Xpert ont été comparés aux paramètres de prévalence de la tuberculose plus élevée. Ces données soutiennent l’utilisation de Xpert dans l’évaluation initiale des suspects de tuberculose et dans les algorithmes évaluant le besoin d’isolement respiratoire.

Xpert MTB / RIF, diagnostic de la tuberculose, isolement respiratoire, mycobactéries non tuberculeuses, co-infection VIH / tuberculoseVoir les commentaires éditoriaux de DiNardo, Lange et Mandalakas sur les pages -Le test Xpert MTB / RIF Xpert Cepheid, Sunnyvale, Californie est un test automatisé d’amplification des acides nucléiques qui peut détecter à la fois Mycobacterium tuberculosis et les mutations associées à la résistance à la rifampicine dans & lt; Dans les études précédentes, Xpert a démontré une spécificité groupée de% et une sensibilité de% dans les AFB à bacilles acido-résistants à bacilloscopie positive et de% dans les échantillons AFB à frottis AFB- à frottis négatif dans la plupart des cas de tuberculose élevée. Les tests Xpert ont été largement implémentés dans les pays à ressources limitées avec une forte prévalence de la tuberculose et comme diagnostic de première ligne de la tuberculose chez les patients infectés par le virus de l’immunodéficience humaine VIH Xpert a été autorisé par la Food and Drug Administration des États-Unis. Cependant, les données publiées pour l’utilisation de Xpert dans les contextes de faible prévalence de la tuberculose tels que les États-Unis sont limitées. impact positif et négatif des valeurs prédictives, et des données pour la performance Xpert dans les milieux cliniques où nontubercu Nous avons également mené une étude multicentrique longitudinale pour évaluer la performance de Xpert aux États-Unis par rapport aux paramètres de prévalence de la tuberculose élevée: Rio de Janeiro, Brésil, incidence annuelle locale de tuberculose de / , et Johannesburg, Afrique du Sud incidence annuelle de tuberculose de /

Méthodes

Participants

Les personnes âgées de ≥ ans évaluées pour une tuberculose pulmonaire définie comme des personnes souffrant de toux, de fièvre, de sueurs nocturnes ou de perte de poids ayant subi un frottis et une culture AFB ont été recrutées sur des sites aux États-Unis et à Rio de Janeiro au Brésil. et Johannesburg, Afrique du Sud Les participants ont reçu & lt; heures de traitement de la tuberculose dans les mois précédant la collecte des expectorations pour les tests Xpert Tous ont été testés pour l’infection par le VIH

Prélèvement et traitement des échantillons

Tous les participants ont fourni des échantillons d’expectorations pour frottis AFB avec coloration fluorescente et culture mycobactérienne en utilisant des milieux liquides et solides, menés selon la norme locale de soins. Résultats d’autres frottis AFB et cultures ont été enregistrées Identification des espèces mycobactériennes par des méthodes approuvées par la FDA, et participants Le test de Xpert a été effectué sur des expectorations résiduelles après traitement pour le frottis ou les cultures de BAAR ou sur des échantillons d’expectorations supplémentaires prélevés dans les jours suivant la maturation de la tuberculose. Les tests Xpert ont été effectués selon les recommandations du fabricant quelques jours après la collecte des échantillons dans les laboratoires américains et localement dans les laboratoires au Brésil et en Afrique du Sud. Si les résultats Xpert initiaux n’étaient pas valides, les tests ont été répétés sur le même échantillon. le volume de l’échantillon était adéquat Les expectorations concentrées par rapport aux non concentrées et la méthode de prélèvement induite par rapport à l’expectoration ont été déterminées par la disponibilité des échantillons et la norme de soins locale. Voir l’annexe supplémentaire pour plus de détails.

Méthodes statistiques

Les objectifs principaux de cette étude étaient d’estimer la sensibilité du test Xpert chez les participants AFB et chez les participants AFB- et la spécificité chez les participants américains par rapport aux résultats de culture mycobactérienne. La taille de l’échantillon pour cette étude a été déterminée au sein de chaque sous-groupe. % intervalles de confiance CI déclarés dans une étude antérieure Cette étude n’était pas alimentée pour les comparaisons faites dans les objectifs secondaires; Sauf indication contraire, toutes les analyses secondaires ont été planifiées. Le statut des BAAR a été défini comme au moins des échantillons d’expectoration ayant un frottis ≥ AFB positif. La tuberculose confirmée par culture a été définie comme étant au moins une culture d’expectoration Le comparateur de référence pour la détection de la tuberculose par le test Xpert était la tuberculose M confirmée par culture et, pour la résistance à la rifampicine, les tests de sensibilité aux médicaments en culture Les IC% ont été calculés à l’aide de la méthode binomiale de Wilson. les spécificités entre les sous-groupes d’intérêt indépendants et chevauchants ont été évaluées à l’aide des tests exacts de Fisher et de McNemar, respectivement; d’autres comparaisons statistiques ont été effectuées en utilisant des tests de Wilcoxon, Fisher exact et χ, toutes les analyses ont été effectuées en utilisant la version du logiciel SAS, avec des résultats considérés comme significatifs à un niveau de P & lt;

Examen des sujets humains

Le protocole a été approuvé par le comité d’éthique / comité d’éthique de chaque site et les centres de contrôle et de prévention des maladies.

RÉSULTATS

Population étudiée

Entre mai et novembre, les participants soumis à une évaluation de la tuberculose pulmonaire étaient inscrits et étaient évaluables. Soixante-quatre pour cent n = ont été recrutés dans des sites américains,% n = provenaient d’Afrique du Sud et% n = provenaient du Brésil. antécédents de tuberculose antérieure et% avaient initié un traitement antituberculeux. heures au moment de la collecte des expectorations Soixante-dix-huit pour cent des États-Unis et% des participants non américains étaient hospitalisés au moment de l’évaluation

Données démographiques du tableau et résultats de base Caractéristique globale N = ≥ Culture TB Positif n = Résultats du premier essai Xpert n = a Résultats des tests Xpert n = b Positif n = Négatif n = P Valuec Positif n = Négatif n = P Valuec Âge à l’entrée, IQR médian – – – – & lt; – – & lt; Sexe masculin Site d’inscription & lt; & lt; Brésil Afrique du Sud États-Unis État d’infection par le VIH Infection par le VIH Sous TAR à l’inscription Infection par le VIH seulement Oui & lt; & lt; Non Symptômes de présentationd Toux Fevere Weight lossf & lt; & lt; Sueurs nocturnes N’importe lequel des résultats CXR ci-dessus & lt; & lt; Résultats anormaux de CXR anormaux seulement Infiltrat & lt; & lt; Cavitation & lt; & lt; Épanchement pleural Autre & lt; & lt; Lieu de l’évaluation Inpatient & lt; & lt; Antécédents de traitement antituberculeuxi & lt; & lt; Traitement antituberculeux actuel Traitement antituberculeux Antécédents de traitement antituberculeux AFB ≥ AFB & lt; & lt; AFB – Détermination finale du CT & lt; & lt; Culture AFB / TB positive Culture AFB- / TB positive TB clinique TB extrapulmonaire Non TB indéterminée Caractéristique globale N = ≥ Culture TB positive n = Résultats du premier test Xpert n = a Résultats des tests Xpert n = b Positif n = Négatif n = P Valuec Positif n = Négatif n = P Valuec Âge à l’entrée, médiane IQR – – – – & lt; – – & lt; Sexe masculin Site d’inscription & lt; & lt; Brésil Afrique du Sud États-Unis État d’infection par le VIH Infection par le VIH Sous TAR à l’inscription Infection par le VIH seulement Oui & lt; & lt; Non Symptômes de présentationd Toux Fevere Weight lossf & lt; & lt; Sueurs nocturnes N’importe lequel des résultats CXR ci-dessus & lt; & lt; Résultats anormaux de CXR anormaux seulement Infiltrat & lt; & lt; Cavitation & lt; & lt; Épanchement pleural Autre & lt; & lt; Lieu de l’évaluation Inpatient & lt; & lt; Antécédents de traitement antituberculeuxi & lt; & lt; Traitement antituberculeux actuel Traitement antituberculeux Antécédents de traitement antituberculeux AFB ≥ AFB & lt; & lt; AFB – Détermination finale du CT & lt; & lt; Culture AFB / TB positive Culture AFB- / TB positive TB clinique TB extrapulmonaire Non TB Les données indéterminées sont exprimées en%, sauf indication contraire, avec des pourcentages de colonne dans les résultats globaux et ≥ Culture TB Résultats positifs et pourcentages de ligne selon les résultats XpertAmbraviations: AFB, bacilles acido-alcoolo-résistants; AFB-, frottis AFB négatif; AFB, AFB frottis positif; ART, thérapie antirétrovirale; CXR, radiographie thoracique; VIH, virus de l’immunodéficience humaine; IQR, intervalle interquartile; Tuberculose, tuberculose; Xpert, Xpert Xpert MTB / RIF Résultats Xpert sur échantillon d’expectoration # Résultats non valides n = et résultats manquants dus à des erreurs de site ou de laboratoire n = ont été exclusb Résultats Xpert par participant basés sur des échantillons d’expectoration positifs = ou Xpert-positifs; négatif = Xpert négatif ou négatif plus invalide / résultat manquant Résultats non valables n = ont été exclusc χ test, sauf perte de poids, sueurs nocturnes, statut AFB, et détermination finale TB Test exact de Fisher, et âge Test de Wilcoxon Les participants peuvent rapporter & gt; Il y avait,,,, et, respectivement, des participants dont la présence de fièvre était inconnue. Il y avait,,, et, respectivement, des participants dont la présence de perte de poids était inconnue. Il y avait,,, et, respectivement, des participants dont la présence de sueurs nocturnes était inconnue. Les participants peuvent avoir & gt; Résultats de CXR anormaux Il y avait,,,,, et, respectivement, des participants dont l’antécédent de traitement de la tuberculose était inconnuj Il y avait,,, et, respectivement, des participants dont le statut de BAAR était inconnu en raison d’erreurs de site / laboratoire.

Figure Vue large Diapositive de téléchargement Diagramme d’évaluation diagnostique du test Xpert MTB / RIF comparé à la culture mycobactérienne rapportée selon les Normes pour la déclaration de précision diagnostique aLes résultats de culture mycobactérienne n’étaient pas disponibles pour les sujets en raison d’une contamination n = ou d’une erreur de site n = Abréviation: MTB, Mycobacterium tuberculosisFigure Voir grandTélécharger la diapositive Diagramme de l’évaluation diagnostique du test Xpert MTB / RIF comparé à la culture mycobactérienne selon les normes pour la précision diagnostique aLes résultats de la culture mycobactérienne n’étaient pas disponibles pour les sujets contaminés n = ou erreur de site n = Abréviation: MTB, Mycobacterium tuberculosis

Etat des frottis de BAAR et diagnostics microbiologiques

Vingt-deux pour cent des participants avaient M tuberculose récupéré à partir de cultures d’expectorations ou plus; % avaient des résultats d’expectoration ≥ AFB Une tuberculose confirmée par culture a été diagnostiquée en% / des participants américains avec des expectorations AFB et en% / des participants des sites non américains% avec des expectorations AFB Six pour cent / des cultures des participants n’ont pas augmenté M tuberculose Douze pour cent des participants américains avaient des cultures qui se développaient NTM Quinze pour cent des participants avaient ou plus de spécimens d’expectorations qui étaient AFB,% / dont M tuberculosis a été récupéré par la culture ont été jugés avoir une tuberculose clinique sur la base de la réponse au traitement empirique

Performances du test Xpert

La sensibilité du premier résultat Xpert était de% Sensibilité du tableau était de% chez les AFB et de% chez les participants AFB- Le premier résultat Xpert présentait une spécificité de% chez les participants sans tuberculose confirmée par la culture Chez les participants chez lesquels NTM était cultivée, la spécificité du premier Xpert restait Le taux de rendement d’un second Xpert était de%, identifiant des participants supplémentaires avec expectorations AFB et avec expectorations AFB, augmentant la sensibilité globale par participant à%% dans AFB et% dans AFB- participants

Tableau Xpert Essai MTB / RIF Sensibilité et spécificité Résultatsa Caractéristique Sensibilité Spécificité PPV NPV Culture TB Positif AFB Frottis Positif / Culture TB Positif AFB Frottis Négatif / TB Culture Positif TB Culture Négatif Tous les participants, premier test Xpert% /% /% /% /% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Statut VIH Infection par le VIH% / b% /% /% /% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] VIH non infecté% / b% /% /% /% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Région Basse TB Prévalence États-Unis% /% /% /% / c% /% / [% -%] [ % -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Prévalence accrue de la tuberculose Brésil & amp; Afrique du Sud% /% /% /% / c% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Collecte des crachats Induite% / % /% /% /% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Expectoré% /% /% /% /% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Traitement des expectorations Non traité% /% / d% /% /% /% / [ % -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Concentré% /% / d% /% /% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Tous les participants, Xpert assayse% /% /% /% /% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Caractéristique Sensibilité Spécificité PPV NPV Culture TB Positif AFB Frottis Positif / TB Culture Positif AFB Frottis Négatif / TB Culture Positif TB Culture Négatif Tous les participants, d’abord Xpert dosage% /% /% /% /% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] statut VIH Infection par le VIH% / b% /% /% /% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] VIH non infecté% / b % /% /% /% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Région Basse TB Prévalence États-Unis% /% / % /% / C% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Prévalence plus élevée de la tuberculose Brésil & amp; Afrique du Sud% /% /% /% / c% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Collecte des crachats Induite% / % /% /% /% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Expectoré% /% /% /% /% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Traitement des expectorations Non traité% /% / d% /% /% /% / [ % -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Concentré% /% / d% /% /% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Tous les participants, Xpert assayse% /% /% /% /% /% / [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] [% -%] Les données sont présentées en% non / Non [% intervalle de confiance] Abréviations: AFB, bacilles acido-alcoolo-résistants; VIH, virus de l’immunodéficience humaine; NPV, valeur prédictive négative; PPV, valeur prédictive positive; TB Pour la première analyse Xpert, les cultures manquantes, les cultures manquantes dues à une erreur de laboratoire / site, les résultats Xpert non valides et les résultats Xpert manquants dus à une erreur de laboratoire ont été exclus. Pour Xperts, les cultures manquantes, les cultures manquantes dues à l’erreur de site / laboratoire et les résultats Xpert non valides ont été exclues. Fisher exact P = comparaison de sensibilité par statut VIH. Fisher exact P = comparaison de spécificité par région. Fisher exact P = comparaison de sensibilité. Deux Xperts sont des résultats Xpert par participant basés sur des échantillons d’expectoration. View LargeLe premier Xpert était faux positif dans un total de participants: avec AFB crachat Mycobacterium avium complexe [MAC] croissance dans les tubes indicateurs de croissance des mycobactéries [MGIT] et les cultures solides et les participants avec AFB-crachat Annexe Tableau supplémentaire des participants AFB- expectorations, sans croissance mycobactérienne et croissance de NTM M abscessus-chelonae, MAC et NTM non identifiés au niveau de l’espèce, dont M tuberculosis a été détecté avec un test de sonde de ligne mais pas par un test Accuprobe approuvé par la FDA avec des tests Xpert a donné un total de résultats faussement positifs, avec la tuberculose détectée sur le premier essai Xpert ainsi que sur les participants avec des résultats Xpert plus positifs sans croissance de tuberculose M, un traitement antituberculeux antérieur a été achevé & gt; mois avant le test Xpert Le premier test Xpert était faussement négatif chez les participants atteints de tuberculose à bacilles confirmés / culture positive et chez ceux qui présentaient une tuberculose à bacilloscopie positive / culture positive; de ces participants avaient une croissance mixte avec M tuberculose et NTM

Paramètres de prévalence faible à élevé

Xpert a montré une sensibilité de% chez les participants AFB et de% chez les participants AFB-, avec une spécificité de%. Un second test Xpert a augmenté la sensibilité globale de% à% chez les participants des États-Unis, avec des résultats Xpert et mycobactériens. Au Brésil et en Afrique du Sud, la sensibilité était de% P = chez les participants à l’AFB et de% P = chez les participants à l’AFB-, et la spécificité était de% P = Tableau

Performance Xpert dans l’algorithme américain d’isolation respiratoire

En comparaison avec le frottis AFB dans l’algorithme d’isolation respiratoire, les dosages Xpert ont identifié tous les cas de tuberculose AFB / culture positive, tandis que le premier test Xpert a identifié% / cas de tuberculose à AFB / culture positive. Dans un troisième cas, Xpert était invalide pour un spécimen d’expectoration concentré distinct de l’échantillon de BAAR qui a produit M tuberculosis. Dans le sous-ensemble des États-Unis, la tuberculose n’a pas été détectée. les participants avec des frottis AFB disponibles, et les tests Xpert ont identifié respectivement% / et% / de tuberculose culture-positive, contre% / et% / de tuberculose culture-positive identifiés avec des frottis AFB, respectivement. la moitié des cas de tuberculose à AFB / culture positive, qui seraient complètement oubliés avec les frottis initiaux de BAAR. sis, un test Xpert négatif unique a prédit l’absence de tuberculose AFB / culture positive avec une valeur prédictive négative NPV de%% aux Etats-Unis et en% hors des Etats-Unis; la VAN était de% pour les tests Xpert négatifs

Sensibilité de table du test Xpert MTB / RIF versus frottis de bacilles acido-résistants pour l’identification des cas de tuberculose confirmée par culture américaine Smear AFB Positif Xpert Résultats positifs P Valeur Résultats Xpert, au moins P positif Frottis AFB n = a Tout% b / [ % -%]% / c [% -%]% / d [% -%] & lt; AFB positif% / d [% -%]% / [% -%] AFB négatif% / e [% -%]% / d [% -%] frottis AFB n = all% / f [% -%]% / c [% -%]% / d [% -%] & lt; AFB positif% / d [% -%]% / [% -%] AFB négatif% / e [% -%]% / d [% -%] Smear AFB Positif Xpert Résultats positifs P Valeur Résultats Xpert, au moins P positif Valeur AFB frottis n = a Tous les% b / [% -%]% / c [% -%]% / d [% -%] & lt; AFB positif% / d [% -%]% / [% -%] AFB négatif% / e [% -%]% / d [% -%] frottis AFB n = all% / f [% -%]% / c [% -%]% / d [% -%] & lt; AFB positif% / d [% -%]% / [% -%] AFB négatif% / e [% -%]% / d [% -%] Les données sont présentées en% non / non [% intervalle de confiance] Comparaison des frottis AFB vs Xpert, en utilisant le test exact de Fisher Abréviation: AFB, bacilles acido-résistants Un Xpert manquant en raison d’une erreur de site / laboratoire AFB in de% pour la comparaison des tests Xpert et de% pour les tests Xpert comparisonc Trois tests Xpert non valides Xpert assaye invalide Deux essais Xpert non valables AFB in de% pour la comparaison de tests Xpert et de% pour la comparaison de tests XpertView Large

Résistance à la rifampicine

Parmi les cas confirmés par culture avec des résultats de sensibilité à la rifampicine disponibles,% / présentaient une résistance à la rifampicine: des États-Unis, d’Afrique du Sud et du Brésil. Le premier Xpert a détecté une résistance à la rifampicine de%; % ICs, -% de cas de résistance à la rifampicine confirmés par culture Xpert n’a détecté ni résistance à la rifampicine ni tuberculose chez des participants atteints de tuberculose AFB- / culture positive dont les M tuberculosis issus de cultures étaient phénotypiquement résistants à la rifampine et présentaient des mutations de rpoB associées à la résistance à la rifampine. Tableau en annexe Les tests avec le test Xpert présentaient une spécificité pour la résistance à la rifampicine de% /; % IC, -% et une VAN de% /; % ICs, -% Chez le participant présentant un test de résistance à la rifampicine Xpert faussement positif, le premier Xpert a indiqué une résistance à la rifampicine, mais le second n’a pas montré de séquençage de l’isolât cultivé.

Performance Xpert chez les participants infectés par le VIH

La sensibilité à Xpert était significativement plus faible chez les participants infectés par le VIH que chez les participants non infectés par le VIH% P =; Tableau Cependant, lorsque évalué par le statut AFB, la sensibilité dans AFB expectorations% vs% et AFB-crachat% vs% chez les personnes infectées et non infectées par le VIH, respectivement, ne différait pas à la fois P & gt; La spécificité globale ne différait pas significativement entre les participants infectés et non infectés par le VIH% vs%; P = Parmi les participants infectés par le VIH avec AFB-crachat, il n’y avait aucune preuve que la sensibilité Xpert a été affectée par le premier test Xpert de cellules CD, P =; Essais Xpert, P =

DISCUSSION

Dans la plus grande étude à ce jour évaluant le test Xpert dans des contextes de faible prévalence de la tuberculose, la performance diagnostique de Xpert aux Etats-Unis était similaire à celle des sites de prévalence de la tuberculose au Brésil et en Afrique du Sud. Ces données soutiennent l’utilisation de Xpert comme outil de diagnostic chez les patients américains subissant une évaluation initiale de la tuberculose. L’algorithme américain actuel pour la tuberculose présumée recommande l’isolement respiratoire jusqu’à ce que les frottis d’expectoration recueillis au moins à des heures d’intervalle soient confirmés. étude, le test Xpert a identifié% de cas de tuberculose AFB / culture positive et les tests Xpert ont identifié tous les cas de tuberculose AFB / culture positive One Xpert a prédit l’absence de tuberculose positive pour la culture avec une VAN de%, et prédit l’absence de frottis. Il est important de noter que le test Xpert était significativement plus sensible que les frottis AFB en le sous-ensemble pour lequel des frottis étaient disponibles% vs%; P & lt; Un test Xpert unique a identifié plus de la moitié des cas de tuberculose AFB- / culture positive, qui ont été complètement manqués par les frottis AFB seul. Le bénéfice d’un second Xpert pour déterminer un besoin d’isolement respiratoire continu dépend du risque d’un faux négatif. Résultat Xpert, rendement incrémental d’un deuxième résultat Xpert et risque de tuberculose infectieuse non détectée L’analyse coûts-bénéfices peut identifier des situations dans lesquelles Xpert seul est adéquat et d’autres où un second Xpert est approprié. Pour les personnes infectées par le VIH, un second Xpert peut être important pour un diagnostic rapide quel que soit l’état des frottis, étant donné la morbidité et la mortalité associées à la co-infection VIH / tuberculose. En outre, l’impact de l’échec à identifier même un petit nombre de patients atteints de tuberculose hautement contagieuse doit être pris en compte. Un grand nombre de personnes plus sensibles peuvent être exposées. Aux États-Unis, la performance de Xpert en présence de NTM est crucial, étant donné la prévalence relativement élevée de NTM; dans cette étude,% des participants américains avaient une croissance de NTM Xpert a bien performé malgré la présence de NTM; Le test Xpert a démontré une spécificité de% chez les participants avec NTM et exclu la tuberculose chez les participants AFB sans M tuberculosis culture-prouvée qui initieraient généralement un traitement antituberculeux sur la base de la détection AFB Des données précédentes ont indiqué aucune réactivité croisée de Xpert avec de multiples espèces de NTM , suggérant que les résultats Xpert faussement positifs pourraient avoir eu la tuberculose présente qui a été envahie en culture par NTM La contribution de l’ADN de NTM excès masquant M tuberculose amplification de la réaction en chaîne de l’ADN polymérase chez les participants avec NTM et résultats Xpert faux négatifs est La résistance à la rifampicine était rare dans cette étude, ce qui limite notre capacité à évaluer Xpert pour détecter la résistance à la rifampicine. Cependant, Xpert a démontré une VAN élevée de% pour l’exclusion de la résistance à la rifampicine. un test moléculaire est recommandé pour confirmer la rifampicine La résistance détectée par Xpert et les tests de sensibilité aux médicaments sont recommandés dans tous les cas de tuberculose aux États-Unis. Il faut souligner que les résultats Xpert négatifs, comme les frottis AFB et même la culture mycobactérienne , n’excluent pas la possibilité En plus des tests moléculaires, les directives américaines recommandent de prélever au moins des échantillons respiratoires pour le frottis et la culture mycobactérienne des BAAR lors de l’évaluation initiale de la tuberculose respiratoire soupçonnée et des tests de sensibilité aux médicaments lorsque M tuberculose est retrouvée que le test Xpert est un ajout précieux à l’arsenal thérapeutique de la tuberculose aux États-Unis et, potentiellement, d’autres paramètres de prévalence inférieure où le test peut faciliter le diagnostic initial de la tuberculose et peut être utilisé conjointement avec d’autres informations cliniques décisions initiales d’isolement respiratoire

Remarques

Remerciements L’équipe remercie les participants et leurs familles, les sites d’inscription et le personnel ainsi que les laboratoires et le personnel qui ont rendu cette étude possible. Le Centre de contrôle et de prévention des maladies CDC Laboratoire de référence, Division de l’élimination de la tuberculose tests de sensibilité aux médicaments à la rifampine Nous remercions les représentants de terrain Jay Dwyer et Nancy Reilly; technologue de laboratoire Joan Dragavon; les gestionnaires de données de laboratoire Oswald Dadson, Anthony Bloom et Angela Ellis; Linda Wieclaw, gestionnaire des données; et le représentant de la communauté, Flavia Nakayima Miiro; le programme externe d’assurance de la qualité des taches de culture sèche GeneXpert dirigé par Wendy Stevens et Lesley Scott; le Comité consultatif sur la formation TBTC du Consortium pour les essais sur la tuberculose, en particulier Amy Kerrigan et Donna Conwell; Nancy Dianis, Kathleen Robergeau-Hunt, Fatima Jones, Bert Arevalo, Vicki Sadique et Jennifer Green Veuillez consulter l’annexe supplémentaire pour les remerciements individuels de site et de laboratoire. Contributions des auteurs AFL a eu un accès complet à toutes les données de l’étude et assume la responsabilité pour l’intégrité des données et l’exactitude de l’analyse des données Concept d’étude et conception: DA, DAB, CF, BG, DVH, MAK, AFL, GHM, IMS, SS, XW Acquisition de données: DA, DAB, CF, BG , DVH, MAK, AFL, GHM, BM, IMS, SS, XW Analyse et interprétation des données: DA, DAB, CF, BG, DVH, MAK, AFL, BM, GHM, SS, XW Rédaction du manuscrit: DA, DAB, CF, DVH, MAK, GHM, XW Révision critique du manuscrit pour le contenu intellectuel important: DA, RA, DAB, MF, FC, BG, EG, PJ, DVH, MAK, AFL, GHM, BM, IMS, FS , SS, ET, YFW, MW, XW Analyse statistique: MAK, XW administratif, technique, ou matériel su PPORT: PJ, BM, YFW Supervision de l’étude: DA, DAB, FC, BG, DVH, MAK, AFL, GHM, SS, X WDisclaimer Le Groupe d’essais cliniques sur le SIDA ACTG et TBTC étaient responsables de la conception et de la conduite de l’étude et de la préparation. examen, et approbation du manuscrit Cepheid a contribué à la conception de l’étude, fourni des cartouches Xpert support, GeneXpert machines, support technique, et le financement pour l’expédition des échantillons et certaines activités de laboratoire, et a passé en revue les manuscrits de l’étude dans ce manuscrit Les produits commerciaux, processus, service, fabricant ou entreprise ne constituent pas son approbation ou sa recommandation par le gouvernement des États-Unis. Le contenu est uniquement la responsabilité des auteurs et ne représente pas nécessairement les opinions officielles de toute agence gouvernementale américaine. Soutien financier Ce travail a été soutenu par l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses par le biais des numéros de subvention ACTG AI, UAI et UM AI; le CDC à travers le TBTC et la Division de l’élimination de la tuberculose, Centre national pour la prévention du VIH, de l’hépatite virale, des MST et de la tuberculose; L’Institut national de la santé mentale, et l’Institut national de recherche dentaire et craniofaciale Conflits d’intérêts potentiel DA a reçu des contrats de recherche de Cepheid, et fait partie d’un groupe de co-inventeurs qui ont inventé la technologie des balises moléculaires et qui reçoivent des revenus des licenciés, y compris Toutefois, le revenu attribuable au test Xpert MTB / RIF qu’il peut recevoir a été irrévocablement plafonné à $ par an en tant que gestion de ce conflit d’intérêts. PJ est un employé de Cepheid DA, DAB, CF. , AFL et YFW ont reçu une subvention de recherche de Cepheid Tous les autres auteurs ne signalent aucun conflit potentiel Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués