Résistance antimicrobienne chez Streptococcus pneumoniae aux États-Unis: avons-nous commencé à prendre le virage de la résistance à certaines classes d’antimicrobiens

Contexte La résistance aux antimicrobiens est apparue comme un problème majeur de Streptococcus pneumoniae aux Etats-Unis au cours des dernières années. Cette étude a été entreprise pour élucider la portée et l’ampleur actuelles de ce problème aux Etats-Unis et pour évaluer les tendances de résistance. Les isolats de pneumoniae provenant de patients atteints d’infections des voies respiratoires communautaires dans des centres médicaux américains ont été caractérisés pendant l’hiver – L’activité des agents antimicrobiens a été évaluée De plus, des isolats sélectionnés ont été examinés pour la présence de mutations dans les régions déterminant la résistance aux quinolones. Les résultats de cette enquête ont été comparés aux résultats des enquêtes précédentes menées de la même manière puisque -Résultats Les taux globaux de résistance définis comme le taux de résistance intermédiaire plus le taux de résistance étaient les suivants : pénicilline,%; ceftriaxone,%; érythromycine,%; la clindamycine,%; tetracycline,%; et triméthoprime-sulfaméthoxazole TMP-SMX,% Aucune résistance n’a été observée avec la vancomycine, le linézolide ou la télithromycine; % d’isolats étaient multirésistants; % des isolats avaient des CMI de ciprofloxacine de ⩾ μg / mL On a estimé que% des isolats de cette collection nationale présentaient des mutations dans les QRDR du parC et / ou du gyrA, les mutations de la parC seulement se produisant le plus souvent en% de tous les isolats. – a indiqué que les taux de résistance aux β-lactamines, aux macrolides, aux tétracyclines, au TMP-SMX et aux médicaments multiples ont stagné ou ont commencé à diminuer. Inversement, la résistance aux fluoroquinolones chez S pneumoniae est de plus en plus répandue. S pneumoniae aux États-Unis, la résistance à d’autres classes d’antimicrobiens devient moins courante

La résistance aux antimicrobiens parmi les isolats cliniques de Streptococcus pneumoniae aux États-Unis a émergé comme un problème important au début des années Depuis lors, la prévalence de la résistance aux β-lactamines a augmenté régulièrement, avec des taux de non-susceptibilité à la pénicilline proches de ] Une tendance similaire a été observée aux États-Unis pour plusieurs classes d’antimicrobiens autres que les β-lactamines, notamment les macrolides, la clindamycine, les tétracyclines, le triméthoprime-sulfaméthoxazole TMP-SMX et le chloramphénicol. être ~% ,% -% ,% -% ,% -% et% , respectivement La seule classe d’antimicrobiens administrés par voie orale qui semble avoir échappé au problème de la résistance émergente chez S pneumoniae sont les fluoroquinolones Cependant, compte tenu de l’introduction récente aux États-Unis d’un traitement oral aux fluoroquinolones pour la prise en charge des infections des voies respiratoires chez l’adulte, l’utilisation croissante d’agents tels que la lévofloxacine, un composé à activité limite contre S pneumoniae, on pourrait s’attendre à ce que les profils de résistance aux fluoroquinolones de cet agent pathogène changent. Dans cette optique, il est intéressant d’examiner les résultats d’un programme national de surveillance multicentrique. Depuis -, nous avons mis en place aux États-Unis un programme de surveillance multicentrique longitudinal appelé Projet Global de Surveillance des Antimicrobiens Respiratoires. GRASP Dans cette étude, des isolats cliniquement significatifs de S pneumoniae sont collectés. des patients dans les centres médicaux à travers le pays et sont envoyés à un laboratoire central pour la caractérisation au moyen de méthodes standard de référence Cette enquête a été menée pendant différentes saisons d’hiver: -, -, -, -, et – Les résultats des premières enquêtes ont été décrit ailleurs [,,] Les résultats de l ‘- enquête a re rapporté ici avec des comparaisons avec les résultats des enquêtes menées au cours des premières périodes d’enquête

Matériaux et méthodes

Un total d’isolats de S pneumoniae ont été caractérisés dans la présente étude. Des isolats ont été collectés à l’un des différents centres médicaux entre décembre et avril et envoyés à l’Iowa College of Medicine Iowa City, IA pour une caractérisation plus poussée. soit vu dans les milieux de soins ambulatoires ou hospitalisé pour & lt; h Des isolats pneumococciques provenant des échantillons et des milieux suivants ont été inclus dans l’étude: liquide de l’oreille moyenne, aspiration sinusale, liquide céphalorachidien et autres fluides corporels normalement stériles, hémocultures et écouvillons conjonctivaux; isolats des voies respiratoires inférieures principalement des expectorations et des broncho-alvéolaires. le lavage a été inclus, mais seulement si les échantillons ont été jugés représentatifs sur la base des résultats de coloration de Gram et si l’isolat a été considéré comme cliniquement significatif par le laboratoire soumettant les isolats ont été expédiés au laboratoire de référence Les isolats ont été identifiés comme S pneumoniae sur la base des résultats de la coloration de Gram et de la morphologie des colonies, des résultats des tests de sensibilité à l’Optochine et de la solubilité du désoxycholate de sodium. Des cultures mères d’isolats ont été préparées dans le laboratoire de référence au moyen du système de microbanque Pr o-Lab Diagnostics et ont été conservés indéfiniment à – ° C

Tableau View largeTélécharger la diapositiveLocalisation et non des isolats fournis par les participants au Projet mondial de surveillance des antimicrobiens respiratoires, Hiver, -Table Voir grandTélécharger la diapositiveLocalisation et non des isolats fournis par les participants au Projet mondial de surveillance des antimicrobiens respiratoires, hiver, -MIC des suivantes Les agents antimicrobiens ont été déterminés par la méthode de microdilution en bouillon décrite par le NCCLS : pénicilline, amoxicilline, amoxicilline-clavulanate, céfaclor, cefprozil, céfuroxime axétil, ceftriaxone, cefpodoxime, cefdinir, cefditoren, chloramphénicol, clindamycine, érythromycine, azithromycine, clarithromycine, ciprofloxacine , lévofloxacine, gatifloxacine, moxifloxacine, gémifloxacine, tétracycline, TMP-SMX, rifampicine, vancomycine, linézolide, télithromycine et quinupristine-dalfopristine Tous les antibiotiques ont été reçus de leurs fabricants respectifs sous forme de poudres de qualité laboratoire. Les isolats ont été testés avec un bouillon Mueller-Hinton additionné de % lysed hor On a incubé le sang à un volume final de μL / puits, avec une concentration finale d’inoculum de ~ × cfu / mL. Les plateaux de microdilution ont été incubés à ° C dans l’air ambiant pendant – h avant la détermination visuelle des CMI. l’étude: S pneumoniae ATCC et les souches de laboratoire I-, et qui ont été sélectionnées pour produire des valeurs de CMI à l’échelle dans les deux plages de concentrations plus élevées et plus faibles de chaque antibiotique testé Les critères d’interprétation MIC du NCCLS ont été utilisés pour calculer les pourcentages d’isolats sensibles, moyennement résistantes et résistantes à chaque agent Caractérisation des mutations dans les régions déterminant la résistance aux quinolones Les QRDR des gènes parC et gyrA ont été réalisées comme décrit ailleurs

Résultats

Les activités in vitro des agents antimicrobiens contre les isolats de S pneumoniae examinés dans cette étude sont résumées dans le tableau Le taux global de résistance à la pénicilline défini comme le taux de résistance intermédiaire plus le taux de résistance était de%% des isolats étaient intermédiaires résistants, et% Parmi les souches résistantes,% présentaient des CMI de pénicilline de μg / mL,% de CMI de μg / mL et le pourcentage restant de CMI de μg / mL. Les taux globaux de résistance aux autres β-lactamines variaient entre% pour la ceftriaxone et% pour le céfaclor Dans une comparaison des CMI antimicrobiennes pour des isolats individuels, les CMI de l’amoxicilline, de l’amoxicilline-clavulanate et de la ceftriaxone étaient généralement les mêmes que les CMI dans l’ensemble des agents de pénicilline; céfuroxime, cefpodoxime et cefdinir MIC étaient des temps plus élevés; le CMI de cefprozil était plus élevé; et le céfaclor MIC était des données fois plus élevées non montrées Les CMI de Cefditoren étaient typiquement – fois plus bas que les CMI de pénicilline pour les isolats individuels

Tableau View largeTélécharger DiapositiveInactivité in vitro des agents antimicrobiens contre des isolats de Streptococcus pneumoniae collectés dans des centres médicaux américains, Hiver, -Table View largeTélécharger une diapositiveInactivité in vitro des agents antimicrobiens contre des isolats de Streptococcus pneumoniae collectés dans des centres médicaux américains, Hiver, -Les taux globaux de Les CMI de clarithromycine étaient constamment plus faibles que les CMI de l’érythromycine, qui étaient à leur tour plus faibles que les CMI de l’azithromycine. Parmi les isolats résistants à l’érythromycine, le% exprimait le CMI du phénotype d’efflux erythromycine de – μg / mL. de ces isolats avaient des CMI de clindamycine de ⩽ μg / mL Un total d’isolats% exprimait le phénotype MLSB macrolide-lincomycine-streptogramine B tous avaient des CMI d’érythromycine de ⩾ μg / mL et des CMI de clindamycine de ⩾ μg / mL Tous sauf de ces isolats avaient de la clindamycine CMI de ⩾ μg / mLLes taux globaux de résistance à la tétracycline, au TMP-SMX et au chloramphénico On n’a pas observé de résistance à la télithromycine. Un seul isolat a été défini comme étant non sensible à la télithromycine MIC, μg / mL. Aucune résistance à la vancomycine ou au linézolide n’a été reconnue. Parmi les isolats caractérisés dans cette étude, être multirésistante La multirésistance a été définie comme une résistance intermédiaire ou une résistance à la pénicilline plus une résistance intermédiaire ou une résistance à au moins des agents suivants: érythromycine, TMP-SMX, chloramphénicol et tétracyclineMIC Les distributions de fréquence des fluoroquinolones examinées dans cette étude sont présentées dans le tableau La gatifloxacine était constamment plus active que la ciprofloxacine et la lévofloxacine, la moxifloxacine était plus active et la gémifloxacine était plus active. Tous les agents présentaient des CMI modales distinctes, comme suit: ciprofloxacine et lévofloxacine, μg / ml; gatifloxacine, μg / mL; moxifloxacine, μg / mL; et gemifloxacine, μg / mL Sur la base des critères d’interprétation NCCLS actuels , les pourcentages suivants d’isolats auraient été classés comme résistants ou résistants à la lévofloxacine, à la gatifloxacine, à la moxifloxacine et à la gémifloxacine:%,%,% et%, Cependant, Chen et al ont suggéré qu’un point de rupture unique de la ciprofloxacine MIC de ⩾ μg / mL est un moyen phénotypique utile pour évaluer l’activité globale des fluoroquinolones contre les pneumocoques parmi les isolats caractérisés par cette étude,% avaient des CMI de ciprofloxacine de ⩾ μg / mL

Tableau View largeTélécharger slideFluoroquinolone distributions de fréquences MIC pour Streptococcus pneumoniae isolats récupérés dans les centres médicaux américains, hiver, -Table View largeTélécharger slideFluoroquinolone distributions de fréquence MIC pour Streptococcus pneumoniae isolats récupérés dans les centres médicaux américains, hiver, -Un total d’isolats ont été examinés pour la présence de mutations dans les QRDR des gènes codant pour les sous-unités C et E de la topoisomérase IV parC et parE et les gènes codant pour les sous-unités A et B de la gyrase A gyrA et gyrB Elles comprenaient tous les isolats avec des CMI de ciprofloxacine de ⩾ μg / mL, des isolats choisis au hasard avec des CMI de ciprofloxacine de μg / mL et des isolats choisis au hasard avec des CMI de ciprofloxacine de μg / mL Les résultats sont présentés dans le tableau

Tableau View largeTélécharger la lameFréquence des mutations dans les régions déterminant la résistance aux quinolones pour les isolats de Streptococcus pneumoniae récupérés dans les centres médicaux américains, selon la CMI de la ciprofloxacine, Hiver, -Table View largeTéléchargementFréquence des mutations dans les régions déterminant la résistance aux quinolones pour les isolats de Streptococcus pneumoniae récupérés à Selon les CMI de la ciprofloxacine, en hiver, les taux de résistance aux agents antimicrobiens sélectionnés, triés selon la région géographique, l’âge du patient et la source des isolats, sont indiqués dans le tableau

Table View largeTélécharger les caractéristiques géographiques, démographiques et cliniques associées aux taux de sensibilité, par agent antimicrobien, pour les isolats pneumococciques récupérés dans les centres médicaux américains, Hiver, -Table Voir grandTéléchargeGraphiques, démographiques et cliniques associées aux taux de sensibilité, par agent antimicrobien, Pour les isolats pneumococciques récupérés dans les centres médicaux des États-Unis, l’hiver, «Cette enquête étant la continuation d’une enquête menée auparavant pendant les hivers de -, -, – et -, il était intéressant d’examiner les tendances de résistance aux antibiotiques. parmi S pneumoniae aux États-Unis au cours de la dernière décennie Les taux nationaux de résistance à la pénicilline, à l’érythromycine, à la tétracycline, au TMP-SMX et aux médicaments multiples pour l’étude actuelle et les enquêtes précédentes sont présentés. Des CMI de ⩾ μg / mL pendant les différentes périodes d’enquête esenté

Figure Vue largeTarifs de résistance pour sélectionner les agents antimicrobiens parmi les isolats du tractus respiratoire de Streptococcus pneumoniae aux États-Unis pendant les hivers depuis – erm, ermB positif; I, intermédiaire résistant; mef, mefA positif; R, résistant; TMP-SMX, triméthoprime-sulfaméthoxazoleFigure View largeTélécharger slideRates de résistance à la sélection d’agents antimicrobiens parmi les isolats des voies respiratoires de Streptococcus pneumoniae aux États-Unis pendant les hivers depuis – herm, ermB positif; I, intermédiaire résistant; mef, mefA positif; R, résistant; TMP-SMX, triméthoprime-sulfaméthoxazoleAvec la pénicilline, la tétracycline et de nombreux médicaments, les taux de résistance semblaient plafonner – et se sont stabilisés depuis lors. Le taux de résistance au TMP-SMX semble diminuer, après un pic de – Les taux de résistance Les pourcentages d’isolats résistants aux macrolides exprimant le phénotype de l’efflux M par rapport au phénotype MLSB de haut niveau sont demeurés presque constants pendant les périodes d’enquête% -% vs% – En outre, les distributions de macrolides MIC parmi les souches avec le phénotype M sont également restées essentiellement inchangées pendant les périodes d’enquête, à la fois lorsque toutes les souches ont été examinées collectivement et que les isolats pneumococciques systémiques ont été examinés séparément. Les isolats avec le phénotype M ont été – et – μg / mL, respectivement, pendant toutes les périodes d’enquête, Avec une CMI de ciprofloxacine de ⩾ μg / mL comme indicateur de la diminution de l’activité des fluoroquinolones, une diminution marquée de l’activité des fluoroquinolones semble s’être produite aux États-Unis au cours de la période de Une autre période, peut-être plus raffinée, de comparaison des pneumocoques par rapport à l’effet des fluoroquinolones au cours du temps est l’analyse des mutations sur la base de la période d’enquête la plus récente. les résultats présentés dans le tableau, nous estimons que% de la collection d’isolats de S pneumoniae présentait des mutations en parC%, gyrA% ou les deux% Une analyse similaire des isolats évalués durant notre enquête a donné un taux de mutation de QRDR estimé de [ ]

Discussion

La résistance à la fluoroquinolone a été clairement documentée dans les groupes clonaux les plus dominants de S pneumoniae résistant aux antimicrobiens aux États-Unis. Comme indiqué ci-dessus, la portée réelle du problème de la résistance aux fluoroquinolones chez S pneumoniae peut être mieux évaluée au moyen d’une analyse de mutation. Un pourcentage élevé d’isolats dans l’étude actuelle ~% a été estimée avoir des mutations dans les QRDR de parC et / ou gyrA Cela représente un taux de mutation qui est sensiblement plus élevé que le taux de% observé dans notre – étude La grande majorité de ces isolats avaient des mutations seulement le QRDR du parC et, par conséquent, a continué à avoir des CMI faibles des fluoroquinolones les plus puissants, de la gatifloxacine, de la moxifloxacine et de la gémifloxacine. Ces organismes, cependant, peuvent représenter un gr En raison de mutations dans le parC et le gyrAIf, nous avons vraiment commencé à tourner le coin sur la résistance de S pneumoniae à des agents autres que les fluoroquinolones dans ce pays. La question peut être posée, pourquoi Au moins les facteurs possibles peuvent être impliqués Des campagnes nationales, régionales et locales pour encourager une utilisation plus appropriée des antibiotiques oraux dans la pratique communautaire chez les patients souffrant de maladies respiratoires aiguës commencent à porter leurs fruits. diminution du fardeau de la pression sélective globale des antibiotiques Il existe au moins quelques preuves circonstancielles que cela puisse être le cas Deuxièmement, l’utilisation croissante de vaccins pédiatriques contre le pneumocoque destinés à prévenir les infections causées par des souches résistantes aux antibiotiques peut avoir une incidence sur la résistance. la période où les taux de résistance chez S pneumoniae semblaient se stabiliser sinon diminuer, une diminution concomitante de la prévalence de la grippe, peut-être en raison de l’augmentation du nombre de personnes vaccinées par le vaccin antigrippal ou de l’efficacité vaccinale accrue Les infections respiratoires virales, particulièrement la grippe, entraînent des prédispositions claires aux infections bactériennes des voies respiratoires secondaires À savoir, une prévalence plus faible de la grippe entraîne moins d’infections bactériennes, y compris celles provoquées par S pneumoniae, ce qui entraîne une pression moins sélective associée à l’utilisation d’antibiotiques. Enfin, nous avons pu être involontairement les bénéficiaires de l’introduction relativement récente des fluoroquinolones. Le lévofloxacine, le premier fluoroquinolone utilisé pour traiter les infections respiratoires, a été introduit dans la pratique clinique aux Etats-Unis. Il a été suivi par la gatifloxacine puis par la moxifloxacine, la lévofloxacine, en particulier. devenir un très populaire Aux États-Unis, le traitement de la sinusite, l’exacerbation aiguë de la bronchite chronique et la pneumonie acquise dans la communauté ont connu une augmentation de la popularité de l’utilisation de non fluoroquinolones pour traiter ces infections, compte tenu de la nature de la maladie. multirésistante, c.-à-d. corésistance aux β-lactamines, macrolides, tétracyclines et / ou TMP-SMX S pneumoniae avec endémicité stable aux États-Unis, la diminution de l’utilisation de ces agents pourrait entraîner une diminution des taux de résistance à tous Une autre conséquence potentielle de l’utilisation accrue des fluoroquinolones dans la prise en charge des infections respiratoires pourrait être l’émergence de la résistance aux fluoroquinolones chez S pneumoniae. Sur la base des résultats de la présente étude, il semble que nous soyons entrés dans une période de changements importants. émergence de la résistance aux fluoroquinolones chez S pneumoniae aux Etats-Unis. Ceci est certainement cohérent avec les récents rapports de Ce profil changeant de l’activité chevauche une période pendant laquelle l’utilisation des fluoroquinolones pour traiter les infections des voies respiratoires a nettement augmenté. La lévofloxacine, en particulier, a clairement été associée à l’émergence de la résistance à S pneumoniae chez les patients individuels Il est possible que cette relation soit influencée par la puissance limite de la lévofloxacine contre S pneumoniae. Il est évident que l’émergence de résistance chez tout pathogène bactérien est un problème à multiples facettes. et les fluoroquinolones, il semble que nous commençons tout juste à observer des changements, du moins aux États-Unis. Compte tenu de la nouveauté et de la portée relativement modeste de ce problème, il est peut-être encore possible d’empêcher le développement d’un problème à l’avenir On espère que les résultats de cette étude seront en quelque sorte dans cet effort

Remerciements

Les auteurs sont reconnaissants envers les personnes suivantes pour avoir fourni les isolats de S pneumoniae caractérisés dans cette étude: Joseph D Schwartzman Liban, NH, Paola C. De Girolami Boston, MA, Paul Iannini Danbury, CT, Kim Chapin Burlington, MA, Phyllis Della- Latta New York, Allan L Truant Philadelphie, PA, Deanna L Kiska Syracuse, NY, Paul Bourbeau Danville, PA, Dwight J Hardy Rochester, NY, Christine C Ginocchio Lake Success, NY, Joseph M Campos Washington, DC, Peter H Gilligan Chapel Hill, Caroline du Nord, Robert Jerris Decatur, Géorgie, Clarisa Suarez Miami Beach, Floride, Stephen Jenkins Charlotte, Caroline du Nord, Ann Hall Tampa, Floride, Diane C Halstead Jacksonville, Floride, Gerri Hall Cleveland, OH, Susan Kehl Milwaukee, WI, Eileen Burd Détroit, MI, Gerald Denys Indianapolis, Indiana, Mary Hayden Chicago, IL, Richard Thomson, Jr Evanston, IL, Beth Grover Mobile, AL, James Snyder Louisville, KY, Ken B Waites Birmingham, AL, Franklin R Cockerill III Rochester , MN, Joan Hoppe-Bauer Saint Louis, Missouri, Rebecca Horvath Kansas City, K S, James Versalovic Houston, TX, Paul M Sud, Jr Dallas, TX, James H Jorgenson San Antonio, TX, Marilyn Bartel Tulsa, OK, Gary Overturf Albuquerque, NM, Michael L Wilson Denver, CO, Karen Carroll Salt Lake City, UT, Michael Saubolle Phoenix, Arizona, Valérie Leslie Las Vegas, NV, Sharon Reed San Diego, CA, David Bruckner Los Angeles, Californie, Rohan Nadarajah San Francisco, CA, David Sewell Portland, OR, Ajit Limaye Seattle, WA, et Ellena M Peterson Irvine, CAFafinancement Abbott Laboratories Conflits d’intérêts potentiels GVD reçoit actuellement des subventions de recherche de Bayer Pharmaceutical Company et d’Astra-Zeneca et siège aux bureaux des conférenciers Abbott, Astra-Zeneca, Bayer, Pfizer, Roche, Sanofi-Aventis et GlaxoSmithKline. Tous les autres auteurs: aucun conflit