Utilisation appropriée du panneau pathogène gastro-intestinal par PCR [Utilisation Spotlight]

Depuis 2012, nous publions un Focus sur l’utilisation dans chaque numéro du Communiqué. Chaque Spotlight offre une vue rapide des meilleures pratiques de gestion de l’utilisation en action. Ce Spotlight est à partir de Janvier 2016.

La diarrhée infectieuse est une maladie courante et généralement auto-limitée. Alors que la plupart des patients présentant des causes infectieuses de diarrhée s’amélioreront d’eux-mêmes, il existe certains scénarios dans lesquels les tests sont indiqués. Le panel gastro-intestinal The FilmArray est un test PCR multiplex fournissant des résultats de tests rapides et rentables. Il est capable de détecter l’ADN ou l’ARN de 22 agents pathogènes en environ 1 heure à partir des selles soumises au laboratoire.Situation

La diarrhée infectieuse est une maladie courante et généralement auto-limitée oculaire. La plupart des patients présentant des causes infectieuses de diarrhée vont s’améliorer par eux-mêmes, et par conséquent, les tests et les traitements ne sont pas nécessaires. Cependant, il existe certains scénarios dans lesquels les tests sont indiqués, par exemple chez les patients présentant des symptômes prolongés ou chez ceux présentant des facteurs de risque ou des signes avant-coureurs d’une maladie grave. Dans ces cas, le nouveau panel de pathogènes gastro-intestinaux est une option rapide et rentable lorsque plusieurs tests seraient autrement effectués. Le panel gastro-intestinal FilmArray est un test PCR multiplex capable de détecter qualitativement l’ADN ou l’ARN de 22 pathogènes (bactéries, parasites et virus) en environ 1 heure de selles soumises au laboratoire dans Cary Blair ou Para-Pak C et S milieu de transport.

Test traditionnel

Les tests de laboratoire traditionnels pour ces pathogènes gastro-intestinaux consistent en une variété d’examens effectués sur des échantillons de selles. Ils comprennent généralement la culture de selles bactériennes pour plusieurs organismes tels que les espèces Salmonella, Shigella et Campylobacter; le soi-disant « examen des ovules et des parasites » pour les protozoaires parasitaires et les vers; méthodes de détection d’antigènes pour les espèces de Cryptosporidium, Giardia duodenalis et rotavirus; et des tests PCR pour les norovirus et les adénovirus responsables de la diarrhée. Ces tests varient en prix et peuvent prendre plusieurs jours pour arriver à un résultat.

Panneau gastro-intestinal BioFire FilmArray

Le panneau gastro-intestinal BioFire FilmArray est un test approuvé par la Food and Drug Administration (FDA) pour tester les selles dans le milieu de transport de Cary Blair. Ce test a été récemment mis en œuvre par Mayo Medical Laboratories et peut être commandé en tant que GIP / Gastro-intestinal Pathogen Panel, PCR, Feces. Ce test est utilisé pour diagnostiquer l’infection causée par les espèces Campylobacter, Clostridium difficile, Plesiomonas shigelloides, les espèces de Salmonella, Vibrio cholerae, Yersinia enterocolitica, Escherichia coli entéroagrégatif, Escherichia coli entéropathogène, Escherichia coli entérotoxigène, Escherichia coli producteur de Shiga, Escherichia coli O157, Shigella / Enteroinvasive Escherichia coli, espèces de Cryptosporidium, Cyclospora cayetanensis, Entamoeba histolytica, Giardia lamblia, adénovirus F 40/41, astrovirus, norovirus, rotavirus ou sapovirus. Le test est relativement coûteux, mais c’est une option rentable lorsque plusieurs tests auraient été commandés.

Ce panel n’est peut-être pas le meilleur test pour chaque scénario, donc un nouvel algorithme pour guider les tests de microbiologie pour les causes infectieuses de diarrhée est disponible sur mayomedicallaboratories.com et inclus à la page 10. En bref, le panel de pathogènes gastro-intestinaux devrait être envisagé diarrhée acquise dans la communauté d’une durée de 7 jours, diarrhée liée au voyage ou diarrhée accompagnée de signes avant-coureurs ou de facteurs de risque de maladie grave, car elle permet de dépister tous les cas courants de diarrhée bactérienne, virale et parasitaire.

Conclusion

En conclusion, la détection rapide par panel multiplex des agents les plus communs des infections entériques bactériennes, virales et parasitaires directement à partir des échantillons de selles est sensible, spécifique et fournit des résultats le jour même, évitant le besoin de culture, test d’antigène, microscopie ou tests d’amplification des acides nucléiques.